Od bitvy u Endoru uběhlo již dlouhých osm let. Kyle se po útrapách, které mu přinesla znalost síly, a po selhání na planetě Dromund Kaas rozhodl vrátit se ke starým způsobům, začal znovu pro Alianci pracovat jako žoldák. S Jan Ors jsou akorát na cestě na Kejim, kde má být údajně opuštěná stará imperiální základna, ale bylo z ní zachyceno vysílání. Ve zprávě zazněla dvě jména - Admirál Fyyar a Údolí Jedi.
Dvojice pronikne do základny a v jejích hlubinách Kyle najde zvláštní krystaly. Podá zprávu Mon Mothmě, dozvídá se od ní, že jde o krystal podobný těm, které se používají ve světelných mečích. Na Kejimu imperiálové testovali možnost umělého získání schopnosti ovládat sílu právě využitím krystalů.
Krystal se těží v dolech na Artusu, kam je Kyle vyslán, aby zjistil, jaká je tamní situace, a případně přerušil těžbu, pokud bude důl v moci Impéria. Krátce po přistání narazí na stormtroopery a o dolech je rozhodnuto - přerušit těžbu a zachránit zajatce.
Kyle pomůže vězňům na povrch. Následně zneškodní štít a iontová děla, bránící přistání transportéru pro zajatce. Jan přistane s Raven's Claw o kus dál v údolí. Kyle se za ní vydá, ale Jan je mezitím zajata. Když dorazí na místo, najde jakéhosi Desanna. Bojují spolu, ale Desann má díky síle převahu. Snadno porazí Katarna a rozkáže své společnici, aby zabila Jan.
Zoufalý Kyle se vydá do Údolí Jedi. Aby mohl pomstít Jan, bude potřebovat sílu jako spojence. Netuší ovšem, že ho Desann sledoval. Vydává se dál na Yavin 4, kde je Skywalkerova Akademie Jedi. Od Luka se dozvídá více podrobností o Desannovi. Je to bývalý student, jeden z mála jeho druhu, kdo ovládá sílu. Z počátku byl dobrý, ale pak zabil jednoho ze studentů, zdůvodňuje to slovy, že byl příliš slabý na to, aby se stal rytířem Jedi. Pak utekl.
Luke připraví pro Kyla trénink, na jehož konci Kyle získá zpět svůj meč. Mezitím Luke pátrá dál a zjistí, že je Desann ve spojení s Rodianem jménem Reelo Baruk. Po Kylově tréninku se Luke a Kyle setkají a mladý mistr Jedi pozná podle Kylova výkonu, že byl v Údolí Jedi. Varuje ho před hněvem a temnou stranou.
Kyle se vydává na planetu Nar Shaddaa, neboli Pašerácký měsíc, jedno z nejprohnilejších míst v galaxii, kde přebývá Reelo Baruk. V místní kantýně poblíž sídla Baruka se snaží z barmana dostat nějaké informace. Ten nabídne, že Baruka přivede, otočí se ke konzoli za sebou, ale místo zavolání Reela se uzavře ve svém baru. Vypukne masakr, návštěvníci kantýny se vrhnou na nezvaného hosta a Kylovi nezbude než je všechny odrovnat. Nakonec z barmana vymlátí informaci, kde je Baruk.
Kyle se dostane do Barukova zařízení na zpracování odpadu a podaří se mu najít Landa Calrissiana, který je zde uvězněn. Od Landa se Kyle dozví heslo pro vstup do hlídané oblasti. Pokračuje do hlubin Barukova sídla a nakonec Reela najde. Než se ale probije přes jeho obranu, Reelo uteče. Kyle tedy alespoň osvobodí Landa a přes drobné potíže se jim podaří připravit Landovu loď Lady Luck k odletu. V poslední chvíli se jim ještě snaží Reelo bránit odstartovat, ale Kyle ho odpráskne laserovým kanónem Lady Luck.
Lando loď vede na Bespin, který je obsazen Desannem a jeho lidmi. Než přiletí pomoc ze Sullustu, rozhodne se Kyle pracovat na vlastní pěst. Lando ho vysadí na spodku Oblačného města a poradí mu, kde je schován jeho droid R5. Kyle postupuje vzhůru a likviduje nepřátele. S pomocí R5 se dostane až do ulic města, kde se spojí s několika policisty a narazí na první reborny - výsledky Desannova pokusu s krystaly z Artusu. Kyle se probije přes imperiální vojáky až na platformu, kde stojí nákladní loď nepřátel.
U lodi je Desannova učednice Tavion. Kyle se s ní střetne a po tvrdém boji ji srazí k zemi. Pomocí síly ji přiškrtí a chystá se ji uvrhnout do hlubin kolem platformy, když žena začne prosit o milost a tvrdit, že Jan Ors ještě žije, že ji nezabila. Kyle se dozví, kde Jan hledat. To trochu zmírní jeho hněv a nechá Tavion jít.
Kyle usedá do nákladní lodi a odlétá k pásu asteroidů, kde má být základna, v níž je vězněna Jan. Kyle základnu objeví a díky tomu, že letí v ukradené lodi, se mu podaří snadno dostat dovnitř. Vystoupí a začíná si probíjet cestu doky, když narazí na Luka Skywalkera. Luke zjistil, že s pomocí síly Údolí Jedi a krystalů z Artusu Desann vytvořil bojovníky vládnoucí silou. Dále zjistil, že se Galak Fyyar zajímá o vzácný minerál cortosis, který odolává světelným mečům.
Opět se rozdělili a Kyle si probíjí cestu hlouběji do základny. Cestou narazil na pár dalších rebornů a nakonec i na protivníky, mající zbroj vyrobenou zřejmě z minerálu, o kterém mluvil Luke. Nakonec Kyle dorazí do podivné řídicí místnosti a když zjistí, že se místnost hýbe, dojde mu, že se ocitl na Desannově hvězdné lodi - na Doomgiveru.
Loď odlétá za nejasným cílem. Podle Skywalkerových pokynů Kyle kontaktuje letku Rogue, která dostane za úkol Doomgiver zničit. Kyle v útrobách Doomgiveru najde Jan. Poté ještě pomůže spojencům a vyřadí z provozu štíty lodi. U generátoru štítů narazí na Galaka Fyyara, který se na Kyla vrhne v domnění, že ho jeho skvělé brnění s vlastním generátorem štítu ochrání. Kylovi chvíli trvá, než přijde na způsob, jak Fyyara porazit, ale nakonec protivníka zabije.
To už mezitím Doomgiver úpí pod útoky letky Rogue. Dochází k výpadku umělé gravitace. Kyle proplouvá lodí až k únikovým modulům a s Jan, která tam již čeká, unikají z umírající lodi. Teprve teď vidí, kam je Doomgiver zanesl - ocitají se nad Yavinem 4, kde se nachází Skywalkerova Akademie Jedi. Desannovým cílem je Akademii zničit a jeho výsadky už na tomto plánu pracují.
Kyle s Jan přistanou v džungli kousek od Akademie. Katarn vyráží směrem k Akademii, cestou neutralizuje útočníky. V chrámu se spojí s dalšími Jedi a bok po boku se probíjejí hlouběji do Akademie. Nakonec Kyle následuje Desanna do katakomb pod Akademií. Projde přes nástrahy až do svatyně, ve které najde Desanna. Desann se pokusí Kyla přitáhnout na svou stranu, Kyle mu to vrátí a zkusí ho přesvědčit, ať se vrátí mezi Jedi. Evidentně se ale domluvit nedokáží a musejí nechat promluvit meče.
V následujícím souboji se prohánějí po dně svatyně, Kyle odráží Desannovy pokusy o útok blesky a snaží se prorazit jeho obranu. Všimne si sloupů v rozích a k jednomu z nich Desanna naláká. Podaří se mu sloup podtít. Desann nestihne zareagovat na nebezpečí a sloup ho přirazí k zemi a rozdrtí mu půlku těla. Je po všem...
Kyle vyjde z katakomb. Na povrchu již boje také utichají. Jan si všimne přicházejícího Kyla a rozběhne se k němu. Padnou si do náruče a dlouze se políbí. Pak se vydají za Lukem, který je již čeká. Luke si myslí, že chce Kyle meč zase vrátit do úschovy, ale Kyle si meč nechá. Ještě sice neví, jestli vstoupí do Akademie, ale každopádně si je jist, že než se bude jakkoliv rozhodovat, zaslouží si s Jan dlouhou dovolenou na plážích Spiry. Pak se teprve uvidí...