Jedi Cal Kestis přilétá jako zajatec na Coruscant v doprovodu několika ozbrojenců. O pár okamžiků později se ukáže, že jde o plán, jak se dostat k senátorovi Sejanovi. Partička senátora zajme, ale při extrakci se na scéně objeví Devátá sestra a misi zhatí. Calovi se podaří inkvizitorku porazit, ale několik jeho spojenců padne a při útěku z Coruscantu je poškozena Calova loď Mantis.
Cal se rozhodne navštívit bývalého parťáka Greeze Drituse, který se usadil na planetě Koboh. Cal nouzově přistane a pěšky se vydá do Greezovy kantýny Pyloon's Saloon. Těsně před kantýnou se zastane místního zoufalce Turgla, který prodal falešný klíč vůdci Bedlam Raiders, který se jmenuje Rayvis. Cal zabije jeho poručíka Zeika a Rayvis radši zmizí. Cal se po střetu seznámí s Domou Dendrou a pak vstoupí do kantýny. Srdečně se přivítá s Greezem a prohodí pár slov o Merrin a Cere a o minulosti. Greez promlouvá Calovi do duše, ale když Cal trvá na boji proti impériu, Greeze mu ukáže pašerácký tunel.
Cal v tunelu najde gyro pro Mantis, ale propadne se do zvláštního podzemí. Narazí na spící droidku Zee a nechtě ji probudí. Je uvězněná a Cal se rozhodne jí pomoci. Zee mu vypráví o planetě Tanalorr, která má být skryta v Koboh Abyss a kde má být chrám Jediů. Se Zee se Cal vrací ke Greezovi, kde už čeká nový Calův spolubojovník Bode Akuna. Zee Cala požádá o pomoc s otevřením Forest Array, kde by měl být klíč k Tanalorru. Cal se vydá k Forest Gate a otevře ji nástrojem od Zee.
Cal se dostane až do Forest Array, kde zachytí echo z minulosti, ve kterém jsou Jediové Dagan Gera a Santari Khri. Dozvídáme se, že chtějí postavit chrám. Pozvou delegaci z Rady Jedi, když dojde k napadení. Dagan si všimne Cala a poprosí o záchranu - vracíme se do současnosti a Cal osvobodí Dagana z kontejneru. Rada vzdala plán s chrámem a Dagana se to dotklo. S Calem se poperou, a když přiletí Rayvis, Dagan ho překvapivě pozná a odletí s ním. Z vrcholu Forest Array zazáří k nebi paprsek.
Cal se vrátí do Outpost, kam zrovna přilétá opravená Mantis. U lodi stojí Zee. Cal vstoupí na palubu Mantis, kde jsou Bode a Greez. Vypráví jim o Daganovi. Cal přesvědčí Greeze, aby zase pilotoval Mantis. Je na čase naštívit Cere na planetě Jedha.
V útrobách trosek se Cal po dlouhé době opět setkává s Merrin a společně se probijí řadou stormtrooperů. Na ochočené potvoře se vydávají za Cere, ale zastihne je pouštní bouře. Přečkají ji a pokračují v cestě. Dorazí do sídla, kde je Cere a k Calovu překvapení i Eno Cordova. Na základnu přilétá i Mantis. Cal jde za Cere do archivu a řekne jí o Tanalorru. Eno zjistí že Dagan by se mohl skrývat na měsíci Kobohu. Greez, Bode a Cal se tam vydají a naleznou jakýsi předmět. Další zastávka je na Kobohu, kde Cal najde další věc a s oběma se vrátí k Enovi.
Zatímco Eno zkoumá předměty, Cal a Merrin jdou pomoci bratrovi Armiasovi, který je ohrožen impy. Cal a Merrin ho sice najdou, ale Armias vzápětí padne. Mají však kontaktní údaje a vracejí se k Cere. Eno mezitím zjistil informace o Koboh Abyss. Nový úkol - najít kompas, který ukazuje cestu do Abyss.
Na Kobohu se dozvídají, že raideři unesli Zee. Cal a Bode se vydávají do jejich základny ve staré vesmírné lodi. Když je okolnosti rozdělí, Cal se prodírá tunely a srazí se s Rayvisem. BD-1 situaci vyřeší, ale Cal spadne kamsi do útrob lodi. Dostane se do míst, kde vyslechne rozhovor Dagana a Rayvise. Rayvis varuje před Jedim, ale Dagan je bezstarostný. Zavelí aktivovat Forest Array. Cal konečně nalézá Zee, ale překvapí je Dagan. Po krátkém boji, do kterého se zapojí Bode, Dagan prchá.
Cal a spol. se vydávají za Rayvisem na Shattered Moon. Cal Rayvise porazí a dozví se, kde je kompas a kam se poděl Dagan. Cal se vrací na Mantis a posádka se vydává na Koboh. Cal vyráží do hor a nalézá hořící imperiální raketoplán.
Cal pokračuje dál až do observatoře, kde se spojí s Bodem a naleznou Dagana. Společně ho porazí, ale kompas je na kusy. Posádka Mantis se vydává zpět na Jedhu. Cordova se ho pokouší opravit a ostatní zatím odpočívají u ohně a pijí čaj. Bode nesdílí nadšení a myslí si, že by měli s Calem jít Tanalorr prozkoumat první.
Vzápětí se ukazuje, že Bode zradil. Zastřelí Cordovu a uteče s kompasem. Cal ho stíhá, střetnou se a Bode Cala porazí a odletí. Impové mezitím napadnou Archív a Cere jim vzdoruje s Merrin a Anchority po boku. Ve chvíli klidu dá BD-1 kontaktní údaje.
Pak přijde Darth Vader.
Cere má šanci, ale nestačí a Vader vítězí. Cal přichází pozdě.
Cal, Greez a Merrin se postarají o těla Ena a Cere a vydávají se za Bodem na Nova Garon. Na základně ISB (Imperial Security Bureau) se Cal dostane až ke komandérovi Denvikovi, který Bodeho úkoloval. Cal si "půjčí" jeho uniformu a dostane se až do Bodeho ubikace, kde najde jeho dceru Katu. Pak přijde Bode. Před jeho dcerou se pánové rozhodnou pro dialog a Cal se dozvídá Bodovu minulost. Bode náhle vyrazí s Katou z místnosti a poštve vojáky na Cala. Cal se vydává za ním, ale impů je příliš mnoho a Bode uniká. Cal se pohybuje na hraně temné strany a jen intervence Merrin ho zastaví, když se chystá zabít komandéra.
Poslední šance - vydat se podle pokynů Santari do Abyss. Prvním krokem je seřídit Array na Kobohu. Zee zůstane na místě, aby Array hlídala. Čas vydat se do Abyss. Cal, Greeze a Merrin šťastně přistávají na povrchu Tanalorru. Bode a Kata se nacházejí v chrámu, který zde Jedi vybudovali. Cal a Merrin se snaží i s pomocí Katy Bodeho přesvědčit, že udělal chybu, ale Bode je zaslepen a dojde k boji, ve kterém Bode před očima své dcery padne...